Em 14 de agosto de 1775, por decreto da imperatriz russa Catarina II, o Zaporozhye Sich foi finalmente abolido. Após a reunificação de uma parte significativa da Pequena Rússia com o estado russo em 1654, os privilégios foram estendidos ao exército Zaporozhye, que foi desfrutado por outras tropas cossacas russas. Os cossacos Zaporozhye desempenharam um papel importante. Os cossacos defenderam as fronteiras do sul da Rússia, desempenharam um papel proeminente nas guerras com o Canato da Crimeia e o Império Otomano. Portanto, os cossacos mantiveram uma certa autonomia do governo central. No entanto, os cossacos abrigaram os fugitivos que se escondiam no Zaporozhye Sich da perseguição às autoridades czaristas. Além disso, havia o perigo de uma revolta contra o centro, uma aliança com os inimigos externos da Rússia.
Assim, em 1709, o koshevoy ataman Kost Gordienko e hetman Mazepa assinaram um acordo aliado com o rei sueco Carlos XII. O Zaporizhzhya Sich juntou-se à aliança de Mazepa e Karl contra a Rússia. Houve vários confrontos entre os cossacos e as tropas russas. Pedro dá a ordem ao Príncipe Menshikov para mover três regimentos de Kiev para o Sich sob o comando do Coronel Yakovlev a fim de "destruir todo o ninho de rebeldes". O Sich foi destruído e mais tarde Peter não permitiu que fosse reconstruído. Os cossacos foram fundados nas terras controladas pelos turcos e pelos tártaros da Crimeia, Kamenskaya (1709-1711) e Aleshkovskaya Sich (1711-1734). No entanto, eles não duraram muito.
Em 1733, quando, após a eclosão da guerra entre o Império Russo e a Turquia, o Khan da Crimeia ordenou que os cossacos da Alyoshkovskaya Sich fossem para a fronteira russa, o general Veisbakh (na época ele estava envolvido na construção do ucraniano linha de fortalezas) presenteou os cossacos com um certificado no trato Krasny Kut, 4 verstas do antigo Chertomlytskaya Sich. Os cossacos receberam uma carta da imperatriz Anna Ioannovna de perdão e aceitação da cidadania russa. Como resultado, o Novo (Podpolnenskaya, ou Pidpilnyanskaya) Sich foi criado, ele existiu até a destruição final do Zaporozhye Sich em 1775.
O novo Sich era muito diferente do antigo. Ela se tornou não apenas militar, mas também um organismo político e econômico. Os cossacos receberam autogoverno total e terras para assentamento. Surgiram novas estruturas - "palanques". Essas eram uma espécie de "províncias" do Sich em Samara, Mius, Bug, Ingulets, etc. Cada palanka era governada por um coronel, esaul e um escrivão, que eram subordinados a Kosh. Foi a terra que se tornou a principal fonte de renda dos cossacos, não o salário. Nas vizinhanças dos Sich instalaram-se "cabras de inverno" - cossacos casados, não tinham direito a voto no parlamento, nem a serem eleitos para cargos públicos e eram obrigados a pagar "fumo" ao tesouro de Sich, isto é, um tipo de imposto familiar. Além dos cossacos casados, passaram a ser chamados assim os estrangeiros (principalmente camponeses, pobres que buscavam uma vida melhor), vindos das províncias da Grande Rússia, da margem direita da Ucrânia e de possessões turcas. Não eram considerados cossacos, mas eram súditos do Sich, forneciam alimentos e pagavam 1 rublo por ano. Os habitantes de Sich viviam da pesca, caça, criação de gado, agricultura e comércio. O capataz recebia receitas de impostos sobre a importação de mercadorias, propriedade de terras, pastagens, pesca.
Os cossacos obedeciam apenas às suas próprias leis, para questões menores eram julgados em palanquetes, para questões significativas - no koshevoy. O infrator poderia ser entregue às autoridades imperiais, mas na maioria das vezes eles próprios eram punidos, até a pena de morte. O Sich rapidamente se tornou uma das regiões prósperas da Rússia. Os palanquetes estavam cobertos de aldeias e fazendas.
No entanto, no Sich também havia sérias contradições entre o capataz e o golot. Assim, o governo czarista violou quase imediatamente a obrigação de distribuir anualmente Sich 20 mil rublos de salário. Já em 1738, eles começaram a dar apenas 4-7 mil. O resto do dinheiro foi ordenado para ser pago com fundos do exército, mas eles estavam vazios. Como resultado, as autoridades começaram a trapacear - distribuíram "publicamente" 4 mil rublos, o resto do dinheiro foi secretamente transferido para os capatazes, os chefes dos kurens. No entanto, os cossacos rapidamente descobriram isso: em 1739, o koshevoy Tukal e os anciãos derrubaram, espancaram e saquearam suas propriedades (o koshevoy foi tão espancado que logo morreu). No futuro, os capatazes continuaram a enriquecer. Em particular, Koshevoy Kalnyshevsky uma vez vendeu 14 mil cavalos de seus rebanhos. Os cossacos comuns estavam na pobreza, todos os benefícios iam a favor do capataz.
Os cossacos comuns trabalhavam para o capataz, pescavam e "gaidamastvo", ou seja, o roubo, também se desenvolvia. No curso inferior do Bug, as fronteiras russa, turca e polonesa convergiram, o que ajudou a se esconder após o saque. Nas décadas de 1750 e 1760, Gaidamache se tornou um verdadeiro desastre na região. As pessoas simplesmente tinham medo de viajar pela região de Bug. Reclamações sobre os cossacos chegavam da Turquia e da Polônia. As instruções das autoridades imperiais estavam simplesmente "pisando fundo no freio". O comércio era muito lucrativo, e muitos dos capatazes e da administração dos palanques participavam. Quando, em 1760, sob pressão das autoridades russas, Koshevoy Beletsky organizou uma incursão para capturar os ladrões, apenas 40 pessoas conseguiram prender. E mesmo então os atamans de kuren proibiram que eles fossem dados, os desmantelaram em kurens e, após o arrependimento, os libertaram. Quando o comando militar russo estabeleceu o patrulhamento da fronteira com cavalaria regular e cossacos suburbanos, começaram as escaramuças armadas.
Outra razão para o conflito entre o Sich e o governo central surgiu. Durante este período, houve um desenvolvimento ativo das áreas antes vazias do Campo Selvagem e os cossacos começaram a defender suas terras "legítimas". Eles basearam suas reivindicações em uma farsa - "uma cópia da carta de Stefan Batory", que supostamente lhes deu terras perto da cidade de Chigirin, ao longo de Samara e do Bug do Sul, a margem esquerda do Dnieper até Seversky Donets. E uma vez que os soberanos russos, começando com Alexei Mikhailovich, confirmaram as "antigas liberdades zaporozhye", a própria palavra "liberdades" começou a ser interpretada em um sentido territorial. Os cossacos zaporozhianos, defendendo suas terras "legítimas", não se limitaram ao uso da força. Eles incendiaram vários novos assentamentos, dispersando os aldeões. Como resultado, os cossacos simplesmente se tornaram insolentes, desafiando o governo central. No entanto, com Elizabeth e Hetman Razumovsky, eles se safaram.
Sob Catarina II, a situação mudou. Ela assumiu seriamente os assuntos da solta Ucrânia. Em 1763, Hetman Razumovsky, que insinuou a condição hereditária de seu cargo, renunciou "por sua própria vontade". O Pequeno Colégio Russo foi restaurado. O general P. A. Rumyantsev foi nomeado seu presidente. Ele encontrou uma imagem de colapso total na Ucrânia. A elite militar, que governava em nome de Razumovsky, ficou completamente fora de controle. Os capatazes se transformaram em nobres todo-poderosos, verdadeiros "príncipes" locais. Chegaram a um ponto em que lutaram entre si, desafiando a terra, armando cossacos e camponeses. A população foi submetida a uma exploração implacável. Os cossacos comuns ou faliram, transformando-se em trabalhadores agrícolas, ou estão engajados na agricultura pessoal. O decreto de 1721 sobre o incentivo à destilação dos cossacos teve um efeito negativo nas tropas. Muitas pessoas beberam até morrer, outras beberam seus lotes de bebida. Como resultado, o Pequeno Exército Russo se decompôs. Rumyantsev não conseguia nem organizar os correios: os ricos não queriam servir, os pobres não tinham oportunidade.
Era necessário tomar medidas para restaurar a capacidade de combate das tropas locais. Em 1764, eles começaram a transformar as unidades cossacas em unidades regulares. Dos regimentos ucranianos, foram criados 5 hussardos: Preto, Amarelo, Azul, Sérvio e Ugorsky. Além disso, foram criados quatro regimentos pikinersky (Elisavetgradsky, Dneprovsky, Donetsk e Lugansky). Mais tarde, vários outros regimentos de hussardos foram criados e a Landmilitia foi reorganizada em unidades de infantaria. No geral, a Ucrânia teve que perder seu status especial e ser igualada a outras províncias russas. Participar desses planos foi um sério obstáculo.
A atenção também foi chamada para o "estado dentro do estado" - o Zaporozhye Sich. Em 1764, Kosh estava subordinado ao Little Russian Collegium. A administração Zaporozhye foi creditada por não realizar mais eleições. Os cossacos ficaram indignados e, ao contrário das instruções, realizaram novas eleições, elegendo Kalnyshevsky como koshevsky. O novo koshevoy foi a São Petersburgo sem permissão para exigir a subordinação direta do Colégio Estrangeiro e levantar a questão das terras Zaporozhye "legais". Rumyantsev sugeriu que a Imperatriz prendesse os delegados. Um projeto de reforma do Sich foi elaborado. Porém, Catarina não tomou medidas duras, uma nova guerra com a Turquia se aproximava, eles não queriam complicar a situação no sul. A Imperatriz recebeu a delegação gentilmente. Isso inspirou os cossacos, retornando ao Sich eles começaram a se gabar de que haviam "assustado" o governo.
Em 1767, foi denunciado que Koshevoy Kalnyshevsky e o escrivão Ivan Globa estavam concordando em entrar em negociações com o sultão turco se o governo não cumprisse suas exigências. Catherine deixou a denúncia sem consequências, mas o destino do Sich já era uma conclusão precipitada. A solução do problema só foi adiada até o fim da guerra com o Império Otomano.
A própria liderança do Sich agravou sua posição precária. Não só desafiou as autoridades russas, mas também entrou em contato com a Crimeia e a Turquia. Na véspera da guerra, os cossacos receberam cartas de Bakhchisarai e Istambul, nas quais foram tentados com a possibilidade de se mudarem para o serviço da Turquia, prometendo um triplo salário. O emissário francês Totleben visitou o Sich em nome do sultão. Kalnyshevsky recusou-se aos turcos, mas não interrompeu a correspondência. Além disso, ele permitiu que Totleben falasse com os cossacos e não o entregou a Rumyantsev. A confusão começou entre a massa cossaca. Quando, em dezembro de 1768, os cossacos foram instruídos a iniciar uma guerra com a Turquia, eles se rebelaram. Kalnyshevsky teve não apenas de reprimir a rebelião, mas também de pedir ajuda à guarnição russa da contenção de Novosechensky. A agitação continuou por vários meses, os cossacos deixaram as fronteiras e os tártaros invadiram a Ucrânia em janeiro de 1769.
Na guerra russo-turca de 1768-1774. Participaram 10 mil cossacos (cerca de mais 4 mil permaneceram no território do Sich). Na guerra, eles mostraram grandes qualidades de combate, destacaram-se no reconhecimento e nas incursões e desempenharam um papel importante nas batalhas de Larga e Cahul. A vitória nesta guerra foi outro motivo para a eliminação do exército Zaporozhye. Com a conclusão do acordo Kuchuk-Kainardzhiyskiy, o Império Russo ganhou acesso ao Mar Negro, a linha defensiva Dnieper foi criada, o Canato da Crimeia estava à beira da destruição. O segundo inimigo histórico da Rússia, a Polônia católica, perdeu seu poder e, em 1772, ocorreu sua primeira partição. Os cossacos Zaporozhye perderam seu papel de defensores das fronteiras ao sul.
Em maio de 1775, o corpo do general Peter Tekeli foi transferido para o Sich. A operação foi exangue. Os anciãos, percebendo que a resistência era inútil, junto com os padres, acalmaram os cossacos comuns. Por decreto de Catarina, o Zaporizhzhya Sich foi abolido. Os cossacos comuns não foram perseguidos. Alguns permaneceram na Ucrânia e se estabeleceram em aldeias e cidades. Alguns dos comandantes receberam patentes de oficial, os capatazes tornaram-se nobres. Apenas três cossacos - Kalnyshevsky, o juiz militar Pavel Golovaty e o escrivão Globa foram condenados por traição e exilados em mosteiros. Kalnyshevsky viveu no Mosteiro Solovetsky até aos 112 anos e morreu em 1803, assumindo a dignidade monástica.
Parte dos cossacos foi para o Danúbio sob o domínio do sultão turco e o Sich Transdanubiano foi criado. Em 1828, os cossacos do Trans-Danúbio passaram para o lado do exército russo e foram perdoados pessoalmente pelo czar Nicolau I. A partir deles, o exército cossaco de Azov foi criado. Na Rússia, durante a guerra com a Turquia, Alexander Suvorov em 1787-1788. dos cossacos do antigo Sich e seus descendentes, ele organizou o "Exército dos Zaporozhianos leais". Em 1790 foi transformado no exército cossaco do Mar Negro e depois recebeu o território da margem esquerda Kuban. Os cossacos participaram ativamente da Guerra do Cáucaso e de outras guerras do Império Russo.